Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D2Q3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D2Q3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms