Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spns3Q9D232 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms