Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd2Q9D1L0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chchd2Q9D1L0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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