Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms