Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Hddc3Q9D114 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Hddc3Q9D114 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hddc3Q9D114 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Hddc3Q9D114 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Hddc3Q9D114 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Hddc3Q9D114 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Hddc3Q9D114 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Hddc3Q9D114 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Hddc3Q9D114 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Hddc3Q9D114 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hddc3Q9D114 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hddc3Q9D114 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hddc3Q9D114 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Hddc3Q9D114 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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