Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl52Q9D0Y8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl52Q9D0Y8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms