Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pbdc1Q9D0B6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pbdc1Q9D0B6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms