Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab3bQ9CZT8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms