Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prelid3bQ9CYY7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms