Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpl11Q9CXW4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms