Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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