Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sugt1Q9CX34 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sugt1Q9CX34 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sugt1Q9CX34 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sugt1Q9CX34 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sugt1Q9CX34 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sugt1Q9CX34 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sugt1Q9CX34 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sugt1Q9CX34 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sugt1Q9CX34 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sugt1Q9CX34 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sugt1Q9CX34 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sugt1Q9CX34 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sugt1Q9CX34 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sugt1Q9CX34 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms