Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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