Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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