Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd12Q9CWU0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms