Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NubplQ9CWD8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms