Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2310003L06RikQ9CV82 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2310003L06RikQ9CV82 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms