Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smurf1Q9CUN6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smurf1Q9CUN6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms