Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhobtb3Q9CTN4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms