Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gdpd1Q9CRY7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gdpd1Q9CRY7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gdpd1Q9CRY7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gdpd1Q9CRY7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gdpd1Q9CRY7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gdpd1Q9CRY7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gdpd1Q9CRY7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gdpd1Q9CRY7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gdpd1Q9CRY7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gdpd1Q9CRY7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms