Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NmbQ9CR53 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NmbQ9CR53 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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