Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQM1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQM1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms