Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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