Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL5

Mrpl18, 39S ribosomal protein L18, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl18Q9CQL5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mrpl18Q9CQL5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mrpl18Q9CQL5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mrpl18Q9CQL5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl18Q9CQL5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms