Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CQF4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms