Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl11Q9CQF0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl11Q9CQF0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms