Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms