Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQB7

Lyrm1, LYR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm1Q9CQB7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lyrm1Q9CQB7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms