Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc5Q9CQA1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc5Q9CQA1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms