Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt88Q9CPR6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms