Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf8Q99PV0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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