Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2a1Q99PM3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms