Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rrbp1Q99PL5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrbp1Q99PL5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms