Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim8Q99PJ2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim8Q99PJ2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms