Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Abcg3Q99P81 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg3Q99P81 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg3Q99P81 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg3Q99P81 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg3Q99P81 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg3Q99P81 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg3Q99P81 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg3Q99P81 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg3Q99P81 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg3Q99P81 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg3Q99P81 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg3Q99P81 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms