Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rassf3Q99P51 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms