Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NsmfQ99NF2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NsmfQ99NF2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms