Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brms1Q99N20 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brms1Q99N20 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms