Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ3

Pink1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pink1Q99MQ3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pink1Q99MQ3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pink1Q99MQ3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pink1Q99MQ3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pink1Q99MQ3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pink1Q99MQ3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms