Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtpbp4Q99ME9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtpbp4Q99ME9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms