Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp1b4Q99ME6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp1b4Q99ME6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms