Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cstf3Q99LI7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms