Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp5lQ99LH9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms