Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf19Q99KP6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms