Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pls3Q99K51 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms