Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lims1Q99JW4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lims1Q99JW4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms