Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GatbQ99JT1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms