Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip2Q99JG7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip2Q99JG7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip2Q99JG7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip2Q99JG7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip2Q99JG7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms