Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgs1Q923W1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms