Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trim59Q922Y2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim59Q922Y2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms